В августе 1965 года гора Торатау получила статус памятника природы республиканского значения.
А в марте 2014 года постановлением Правительства РБ был определен режим охраны данного природного комплекса.
Согласно этому документу, здесь запрещены добыча горных пород, все виды строительства, выпас скота, охота на животных и сбор насекомых, растений, любая другая хозяйственная деятельность, которая может привести к нарушению первозданного вида шихана.
Трудно переоценить значе-ние горы Торатау для сохране-ния растений, занесенных в Красную книгу России и Башкортостана. Сейчас насчитывается более 19 видов редких цветов и трав.
Разнообразен и животный мир, в котором можно встретить хищных и певчих птиц, необычных бабочек и кузнечиков.
Помимо неповторимой флоры и фауны гора Торатау примечательна еще и тем, что является практически единственным в мире рифовым массивом, образованным 230 миллионов лет назад и возвышающимся на высоте более 400 метров над уровнем океана.